Около 40 лет о. Николай служил на благо Церкви, был известен как добрый пастырь, исполненный мудрости и духовного опыта. Находясь на посту благочинного Подольского района, в годы лютых гонений он ревностно следил за соблюдением церковных канонов, отстаивал права Церкви, заступался за священников своего благочиния. Отец Николай был добрым любящим пастырем, отличался духовной стойкостью и бесстрашием. Братья о. Николая о.Александр и о. Василий Агафонниковы были также причислены к лику святых